Giglio, Rosa
(2011)
I geni cotH e cotG di Bacillus subtilis:
analisi trascrizonale e modello evolutivo.
[Tesi di dottorato]
(Unpublished)
| Item Type: |
Tesi di dottorato
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| Language: |
Italiano |
| Title: |
I geni cotH e cotG di Bacillus subtilis:
analisi trascrizonale e modello evolutivo |
| Creators: |
| Creators | Email |
|---|
| Giglio, Rosa | rosagiglio@hotmail.it |
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| Date: |
30 November 2011 |
| Number of Pages: |
179 |
| Institution: |
Università degli Studi di Napoli Federico II |
| Department: |
Biologia strutturale e funzionale |
| Doctoral School: |
Scienze biologiche |
| PHD name: |
Biologia applicata |
| PHD cycle: |
23 |
| PHD Coordinator: |
| name | email |
|---|
| Ricca, Ezio | ericca@unina.it |
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| Tutor: |
| name | email |
|---|
| Baccigalupi, Loredana | lorbacci@cds.unina.it |
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| Date: |
30 November 2011 |
| Number of Pages: |
179 |
| Uncontrolled Keywords: |
CotH, CotG, Bacillus subtilis |
| MIUR S.S.D.: |
Area 05 - Scienze biologiche > BIO/19 - Microbiologia generale |
| Date Deposited: |
06 Dec 2011 09:59 |
| Last Modified: |
30 Apr 2014 19:48 |
| URI: |
http://www.fedoa.unina.it/id/eprint/8897 |
| DOI: |
10.6092/UNINA/FEDOA/8897 |
Abstract
I geni cotG e cotH e di Bacillus subtilis codificano due della tunica sporale. I due
i geni sono adiacenti sul cromosoma e divergentemente trascritto dal fattore sigma K dell'RNA polimerasi. Il promotore del gene cotH è localizzato 812 bp a monte dell'inizio della sua
regione codificante e il gene cotG divergente è interamente contenuta fra il promotore e la parte di codifica di cotH. Una analisi bioinformatica di tutti i genomi procarioti completamente sequenziati ha dimostrato che tale organizzazione genica non è comune nei bacilli sporigeni. Infatti, CotG è presente solo in B. subtilis, B. amyloliquefaciens, e B. atrophaeus e in due ceppi Geobacillus. Quando presenti, cotG codifica sempre una proteina modulare composta di ripetizioni in tandem ed è sempre vicino ma divergentemente trascritta rispetto alla cotH.
Dati bioinformatica e filogenetici suggeriscono che tali organizzazioni geniche siano il risultato di una comune evoluzione e che la struttura modulare dei geni esistenti cotG sia il risultato di una serie di eventi di allungamento genico a partire da un minigene ancestrale. Inoltre la costruzione del mutante cotG-, ha messo in evidenza che la proteina CotG, probabilmente, ha un effetto negativo su CotC (degradazione?) e questo effetto è controbilanciato dalla presenza di
CotH che, in qualche modo, protegge CotC dalla degradazione.
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