I geni cotH e cotG di Bacillus subtilis: analisi trascrizonale e modello evolutivo

giglio, rosa (2011) I geni cotH e cotG di Bacillus subtilis: analisi trascrizonale e modello evolutivo. [Tesi di dottorato] (Inedito)

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Abstract

I geni cotG e cotH e di Bacillus subtilis codificano due della tunica sporale. I due i geni sono adiacenti sul cromosoma e divergentemente trascritto dal fattore sigma K dell'RNA polimerasi. Il promotore del gene cotH è localizzato 812 bp a monte dell'inizio della sua regione codificante e il gene cotG divergente è interamente contenuta fra il promotore e la parte di codifica di cotH. Una analisi bioinformatica di tutti i genomi procarioti completamente sequenziati ha dimostrato che tale organizzazione genica non è comune nei bacilli sporigeni. Infatti, CotG è presente solo in B. subtilis, B. amyloliquefaciens, e B. atrophaeus e in due ceppi Geobacillus. Quando presenti, cotG codifica sempre una proteina modulare composta di ripetizioni in tandem ed è sempre vicino ma divergentemente trascritta rispetto alla cotH. Dati bioinformatica e filogenetici suggeriscono che tali organizzazioni geniche siano il risultato di una comune evoluzione e che la struttura modulare dei geni esistenti cotG sia il risultato di una serie di eventi di allungamento genico a partire da un minigene ancestrale. Inoltre la costruzione del mutante cotG-, ha messo in evidenza che la proteina CotG, probabilmente, ha un effetto negativo su CotC (degradazione?) e questo effetto è controbilanciato dalla presenza di CotH che, in qualche modo, protegge CotC dalla degradazione.

Tipologia di documento:Tesi di dottorato
Parole chiave:CotH, CotG, Bacillus subtilis
Settori scientifico-disciplinari MIUR:Area 05 Scienze biologiche > BIO/19 MICROBIOLOGIA GENERALE
Coordinatori della Scuola di dottorato:
Coordinatore del Corso di dottoratoe-mail (se nota)
ricca, ezioericca@unina.it
Tutor della Scuola di dottorato:
Tutor del Corso di dottoratoe-mail (se nota)
baccigalupi, loredanalorbacci@cds.unina.it
Stato del full text:Accessibile
Data:30 Novembre 2011
Numero di pagine:179
Istituzione:Università di Napoli Federico II
Dipartimento o Struttura:Biologia strutturale e funzionale
Stato dell'Eprint:Inedito
Scuola di dottorato:Scienze biologiche
Denominazione del dottorato:Biologia applicata
Ciclo di dottorato:23
Numero di sistema:8897
Depositato il:06 Dicembre 2011 10:59
Ultima modifica:18 Giugno 2012 10:41

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