Barbieri, Mariano (2013) Statistical Mechanics Models of Chromatin Architecture. [Tesi di dottorato]
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Tipologia del documento: | Tesi di dottorato |
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Lingua: | English |
Titolo: | Statistical Mechanics Models of Chromatin Architecture |
Autori: | Autore Email Barbieri, Mariano mariano.barbieri@gmail.com |
Data: | 2 Aprile 2013 |
Numero di pagine: | 64 |
Istituzione: | Università degli Studi di Napoli Federico II |
Dipartimento: | Fisica |
Scuola di dottorato: | Scienze fisiche |
Dottorato: | Fisica fondamentale ed applicata |
Ciclo di dottorato: | 25 |
Coordinatore del Corso di dottorato: | nome email Velotta, Raffaele velotta@na.infn.it |
Tutor: | nome email Nicodemi, Mario nicodem@na.infn.it |
Data: | 2 Aprile 2013 |
Numero di pagine: | 64 |
Parole chiave: | genome organization,genome architecture,long-range chromatin interactions,fluorescence in situ hybridization,Monte Carlo simulation |
Settori scientifico-disciplinari del MIUR: | Area 02 - Scienze fisiche > FIS/02 - Fisica teorica, modelli e metodi matematici Area 02 - Scienze fisiche > FIS/07 - Fisica applicata (a beni culturali, ambientali, biologia e medicina) |
Depositato il: | 09 Apr 2013 14:00 |
Ultima modifica: | 18 Lug 2014 10:12 |
URI: | http://www.fedoa.unina.it/id/eprint/9492 |
DOI: | 10.6092/UNINA/FEDOA/9492 |
Abstract
We considered phenomena that recent quantitative biological data are unveiling to happen in cell nucleus, by means of Statistical Mechanics tools. In particular we focused on genome spatial self-organization, and its striking connection with genetic expression process, hence with future perspective on disease studies. We lead our research efforts starting from biological data obtained by a direct collaboration with Ana Pombo's biologists group of London Imperial College and her working group. I've statistically characterized our proposed model for genome self-organization by means of massive Motecarlo Simulations. Furthermore I've analitically characterized a model predicting Symmetry Breaking mechanism for some observed phenomenologies into the nucleus.
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