Statistical mechanics of genome regulation: the case of X chromosome inactivation

Scialdone, Antonio (2010) Statistical mechanics of genome regulation: the case of X chromosome inactivation. [Tesi di dottorato] (Inedito)

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Abstract

The aim of my PhD research project was to discover the mechanisms behind X Chromosome Inactivation (XCI) one of the most intriguing issues of the current mammalian Biology. XCI is the process whereby a female mammal cell silences one of its two X chromosomes randomly chosen, to equalize the dosage of X products with respect to males (having just one X). We used theoretical models from Statistical Physics and their massive computer simulations to dissect this chromosome-wide stochastic regulatory process. The importance of these investigations goes beyond the XCI, as the comprehension of this process, can indeed shed light on a whole class of regulatory mechanisms involving the genome. By means of our quantitive models, which already found some important experimental confirmations, we were able to provide a new deeper level of understanding of the underlying physical and molecular mechanisms. Precise predictions are given for many genetic/chemical manipulations and a new generation of experiments can be designed. A close interplay between theory and experiments, was guaranteed in our project by the collaboration with an experimental group from Harvard Medical School, USA.

Tipologia di documento:Tesi di dottorato
Parole chiave:Statistical Mechanics; genome regulation; X inactivation; DNA spatial architecture; stochastic regulatory mechanisms
Settori scientifico-disciplinari MIUR:Area 02 Scienze fisiche > FIS/02 FISICA TEORICA, MODELLI E METODI MATEMATICI
Area 02 Scienze fisiche > FIS/07 FISICA APPLICATA (A BENI CULTURALI, AMBIENTALI, BIOLOGIA E MEDICINA)
Coordinatori della Scuola di dottorato:
Coordinatore del Corso di dottoratoe-mail (se nota)
Marrucci, Lorenzolorenzo.marrucci@na.infn.it
Tutor della Scuola di dottorato:
Tutor del Corso di dottoratoe-mail (se nota)
Nicodemi, Mariomario.nicodemi@na.infn.it
Stato del full text:Accessibile
Data:24 Novembre 2010
Numero di pagine:102
Istituzione:Università degli Studi di Napoli Federico II
Dipartimento o Struttura:Scienze fisiche
Tipo di tesi:Dottorato
Stato dell'Eprint:Inedito
Scuola di dottorato:Scienze fisiche
Denominazione del dottorato:Fisica fondamentale ed applicata
Ciclo di dottorato:23
Numero di sistema:7951
Depositato il:08 Dicembre 2010 13:01
Ultima modifica:23 Maggio 2011 16:03

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